Descreva, em etapas claras, como a aplicação de metabarcoding por eDNA pode alterar a estimativa de riqueza…

Questão

Descreva, em etapas claras, como a aplicação de metabarcoding por eDNA pode alterar a estimativa de riqueza taxonômica em uma reserva florestal. Inclua procedimentos laboratoriais e bioinformáticos, principais fontes de viés e medidas para minimizar erros de identificação taxonômica.

✍️ Questão dissertativa: veja abaixo a resposta esperada e a explicação.

Resposta esperada

Etapas: 1) amostragem padronizada de água/solo; 2) controle de campo e replicatas; 3) extração de eDNA; 4) PCR com múltiplos primers universais; 5) sequenciamento de alta produtividade; 6) filtragem de qualidade; 7) geração de ASVs/OTUs; 8) atribuição taxonômica contra banco de referência; 9) validação com dados morfológicos locais. Fontes de viés: primer bias, degradação do DNA, contaminação, banco de referências incompleto e erros de atribuição. Mitigação: usar conjuntos de primers complementares, replicatas técnicas/biológicas, controles negativos/positivos, pipelines conservadores, atualizar e complementar bancos com sequências locais e cruzar resultados com inventário morfológico para confirmar táxons-chave.

Explicação

A resposta apresenta um fluxo lógico e sequencial que abrange desde a amostragem até a validação dos dados, abordando todos os aspectos essenciais da aplicação de metabarcoding por eDNA. Além disso, identifica fontes de viés que podem impactar a estimativa de riqueza taxonômica e propõe medidas práticas para mitigá-las, demonstrando um entendimento profundo do tema. Essa abordagem abrangente e detalhada é fundamental para garantir a precisão e a confiabilidade nas estimativas de diversidade biológica em reservas florestais.

Raio-X da questão

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